Então Marcos, eu não sei muito sobre o teu caso, mas sei que comigo isso não acontece em relação à filmagem, mas acontece quando gravo minha tela jogando (o gravador de tela que uso é o Shadow Play) e quando jogo o video no Premiere CC 2015, ele atrasa o áudio, procurei em vários lugares e não achei nada muito aprofundado, mas sei que o vídeo fica em 59 quadros e não é um "framerate" constante... então ele dessincroniza o áudio. No Media Player ele roda normal, esse problema só acontece quando jogo no programa de edição. Então eu comecei a usar um conversor (HandBrake) aí eu configuro ele pra converter o vídeo nas mesmas configs. que o original, e mudo apenas um detalhe: invés de "Variable Framerate", eu coloco em "Constant Framerate".... aí os frames ficam estáveis e não ocorre a dessincronização. Caso queira baixar o programa, ele é gratuito, link abaixo: https://handbrake.fr/
Espero ter ajudado em algo