Bom dia amigo.
Ontem ao procurar bastante na net problemas relacionados a isso acho esbarrei em uma alternativa.
Se vocês repararem no gerenciador de tarefas e na coluna disco, apesar de estar com 100% tomado e em percentuais o Tal "Sistema e memória compactada" vulgo "Sistem" estarem consumindo muito se você alterar para exibir por MB/s vai ver q a velocidade esta muito baixa, o meu oscilava entre 0,1 MB/s e 4,0 MB/s enquanto um HD de 7200rpm deve atingir 200MB/s. Conforme imagem abaixo:
O HD é basicamente mecânico, e por algum desgaste a BIOS não enxergava o HD com capacidade para 7200rpm e sim com 800rpm.
Para solucionar o problema executei o Banchmark do AIDA64, O AIDA64 força o HD a ir a sua velocidade máxima e parece q isso destravou meu HD. Veja se resolve, agora já sabendo que o problema foi mecânico do HD pense em subistituir por um novo o mais rápido possível.