Tive exatamente o mesmo problema (em um Acer Aspire 3100-1551). Teclado, Mouse (Touchpad) e USB que não funcionavam. Consegui resolver na cagada. Depois de tentar as várias dicas de não usar bateria, segurar pwr sem energia e religar, etc. Tentei bootar um livecd linux. Estava sem bateria e só com a fonte.
1° tentei o ubuntu-9.10 sem sucesso, bootou mas o teclado, mouse e usb não funcionaram.
2° bootei o kurumin-7.0r3, o teclado funcionou e o mouse tb porém lento. Daí fui backupear os dados. Consegui configurar wireless, montar as partições windows e transferir para um compartilhamento de outro pc usando o Smb4k. Depois de um tempo fazendo as configurações etc. o mouse voltou a funcionar "suave", sem lentidão. Interrompi a transferência e desliguei o note forçadamente direto no cabo de energia (sem shutdown no kurumin). Quando religuei (ainda sem bateria), FUNCIONOU! Não me pergunte como.
Resumindo: Sem bateria > boot kurumin-7.0r3 > ir usando até o mouse "lento" voltar a mover normalmente > retirar o cabo de energia desligando forçadamente > religar ainda sem bateria.
Vale tentar...