Eu estava com o mesmo problema. No meu caso ainda, nenhuma miniatura era exibida mesmo estando apenas uma janela aberta.
Alterei o registro do windows como mencionado pelo @tekinha
Desta forma, fique na mesma situação em que a miniatura aparecia com apenas uma janela aberta.
Para exibir mais miniaturas, foi necessário alterar outro registro do windows.
HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Taskband
Procure pelo item NumThumbnails e altere o valor. Insira o número de miniaturas que deseja exibir.
Por exemplo: 3 (não esqueça de marcar a opção "decimal" na hora de alterar) -> até 3 miniaturas serão exibidas; quando você abrir a quarta janela do mesmo programa, então passará a exibir a lista de janelas ao invés das miniaturas.
Espero ter ajudado.
Att.